16.08.2024
В 2024 году 14-я Международная Мультиконференция «Биоинформатика регуляции и структуры геномов/системная биология» проходила с 5 по 10 августа в Новосибирске на базе Института цитологии и генетики СО РАН и Новосибирского государственного университета.
Конференция BGRS проводится раз в два года в течение 25 лет (начиная с 1998 года). Организаторы – Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирский государственный университет и Научный совет по биоинформатике СО РАН. Отличительная особенность BGRS/SB – ее мультидисциплинарность. В программу конференции входят симпозиумы и секции, рассматривающие широкий круг проблем, решение которых требует интеграции теоретических и экспериментальных подходов. Такая широкая тематика и привлечение ведущих мировых исследователей делают ее — ведущей российской конференцией в области биоинформатики.
В этом году в мероприятии приняли участие около тысячи ученых из разных стран. В программе конференции – 13 тематических симпозиумов, более 500 устных и около 300 стендовых докладов.
НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ выступил организатором симпозиума «Эволюционная, популяционная и медицинская геномика/генетика человека: компьютерные и экспериментальные подходы». Модераторы симпозиума: директор Томского НИМЦ, академик РАН Вадим Степанов и зам. директора по развитию Томского НИМЦ; ведущий научный сотрудник, руководитель лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики, д-р биол. наук Станислав Васильев.
Современная генетика и молекулярная биология позволяют одновременно оценивать количество и состояние тысяч генов и белков. Объединение этих больших данных в единую картину требует развития принципиально новых подходов, в том числе с использованием искусственного интеллекта. BGRS - ведущая конференция в области системной биологии и биоинформатики. Она уже многие годы является одной из крупнейших площадок для обсуждения важнейших вопросов в области анализа больших генетических данных, выявления механизмов взаимодействия различных уровней организации клетки и организма, поиска механизмов патогенеза болезней человека и путей их лечения. Для биомедицинских исследователей участие в такой конференции - возможность увидеть новые возможности анализа своих результатов, знакомство со специалистами в области биоинформатики и системной биологии, — прокомментировал Станислав Васильев.
В секции «Медицинская геномика/генетика человека» данного симпозиума с устными докладами выступили:
- старший научный сотрудник лаборатории популяционной генетики НИИ медицинской генетики, канд. биол. наук Елена Брагина, доклад «Феномен сочетания болезней: роль генетических факторов в развитии синтропий и дистропий»;
- младший научный сотрудник лаборатории эволюционной генетики НИИ медицинской генетики Анастасия Бабовская, доклад «Популяционная транскриптомика преэклампсии»;
- младший научный сотрудник лаборатории онтогенетики НИИ медицинской генетики Дмитрий Федотов, доклад «Спектр CNV у пациентов с нарушениями психомоторного развития».
Стендовые доклады представили:
- ученый секретарь НИИ медицинской генетики, научный сотрудник лаборатории популяционной генетики, канд. биол. наук Надежда Бабушкина, доклад «Выявление дифференциально метилированных при бронхиальной астме и туберкулезе легких генов (реанализ данных)»;
- научный сотрудник лаборатории популяционной генетики НИИ медицинской генетики, канд. биол. наук Ирина Гончарова, доклад «Метилирование генов некодирующих РНК при аневризме и атеросклерозе восходящей аорты».
Научные сотрудники Томского НИМЦ приняли активное участие в работе симпозиума «Геномика, транскриптомика и биоинформатика».
- Младший научный сотрудник лаборатории геномной идентификации НИИ медицинской генетики Мария Гавриленко представила доклад «Анализ событий альтернативного сплайсинга в децидуальных клетках плаценты человека».
- Младший научный сотрудник лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Анна Хозяинова представила доклад «Выявление общей молекулярной программы эмбрио- и онкогенеза с помощью секвенирования РНК единичных клеток», который был поддержан спонсором конференции ООО «СкайДжин».
В секции «Популяционная и эволюционная геномика/генетика человека» симпозиума «Эволюционная, популяционная и медицинская геномика/генетика человека: компьютерные и экспериментальные подходы» представили устные доклады:
- ведущий научный сотрудник лаборатории эволюционной генетики Научно-исследовательского института медицинской генетики, д-р биол. наук Владимир Харьков, доклад «Филогения и филогеография Y-хромосомной гаплогруппы N1a1a1a1a-F1419»;
- младший научный сотрудник лаборатории геномной идентификации НИИ медицинской генетики Лариса Валихова, доклад «Генетическая структура ненцев по 21 аутосомному STR-маркеру»
Стендовые доклады в данной секции представили:
- старший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики и биохимии НИИ психического здоровья, канд. биол. наук «Ассоциация полиморфного варианта гена IL6 с тяжестью депрессивных симптомов» Наталья Вялова;
- научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики и биохимии НИИ психического здоровья, канд. мед. наук Ирина Меднова, доклад «Ассоциация полиморфизма rs753482 гена eNOS с риском абдоминального ожирения у больных шизофренией, принимающих атипичные антипсихотики»;
- старший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики и биохимии НИИ психического здоровья, канд. мед. наук Людмила Смирнова, доклад «Использование инструмента MaxQuant для поиска бимаркеров БАР».
На симпозиуме «Биомедицина, биоинформатика и системная компьютерная биология», секция «Экспрессия генов и болезни человека», с устным докладом «Количественные различия в белковом спектре сыворотки крови больных БАР с депрессивным и смешанным эпизодом» выступил младший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики и биохимии НИИ психического здоровья Александр Серегин.
В той же секции стендовый доклад представила старший научный сотрудник лаборатории эволюционной генетики НИИ медицинской генетики, канд. мед. наук Екатерина Трифонова. Тема доклада «Преэклампсия: взгляд на патогенез заболевания через призму геномики и транскриптомики».
Также на данном симпозиуме в секции «Молекулярная патология, диагностика и терапия» старший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики и биохимии НИИ психического здоровья Людмила Смирнова представила стендовый доклад «Каталазная активность сывороточных IgG и фрагментов IgG, элюированных с поверхности внеклеточных везикул больных с колоректальным раком: первые результаты».
В секции «Общие проблемы в изучении когнитивных процессов; модели когнитивной деятельности» Людмила Смирнова также представила устный доклад «Использование инструмента MaxQuant для поиска бимаркеров БАР».
На симпозиуме «Фундаментальные генетические/клеточные системы/процессы: компьютерные и экспериментальные подходы» научный сотрудник лаборатории популяционной генетики НИИ медицинской генетики, канд. биол. наук Надежда Бабушкина выступила с докладом «Метилирование регуляторных регионов апоптоз-aссоциированных генов при дистропии». Также Надежда Петровна представила постерный доклад.
С устным докладом «Сочетания вариантов митохондриальной ДНК как фактор риска развития нарушений сердечного ритма» в симпозиуме «Генетика и системная биология старения» выступила старший научный сотрудник лаборатории популяционной генетики Научно-исследовательского института медицинской генетики, канд. биол. наук Мария Голубенко.
С пленарным докладом «Омиксные технологии на уровне единичных клеток и пространственного разрешения: возможности и перспективы» в завершающий день конференции выступил заведующий лабораторией биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии, д-р биол. наук Евгений Денисов.