Лаборатория молекулярной генетики и биохимии
Научное подразделение было основано в 2003 году и изначально носило название «Лаборатория клеточных и молекулярно-биологических исследований» (рук. – профессор, д-р мед. наук С.А. Иванова). Свое актуальное название лаборатория получила в 2013.
В лаборатории молекулярной генетики и биохимии проводится поиск потенциальных биомаркеров психических расстройств на основе омиксных технологий:
- Применение геномных технологий, протеомного анализа, методов целевой и нецелевой метаболомики позволяет выявлять потенциальные гены-кандидаты и специфические нарушения в спектре белков, аминокислот, ацилкарнитинов и других метаболитов, играющих значимую роль в патогенезе основных социально значимых психических и аддиктивных расстройств и позволяющих рассматривать их в качестве потенциальных маркёровриска развития и течения заболевания.
- Применение протеомных технологий, с использованием масс-спектрометрии высокого разрешения и использование различных поисковых машин для идентификации результатов анализа позволили выявить биологические процессы, классы и функциональные подтипы белков специфично характеризующие то или иное психическое расстройство; впервые идентифицировать минорные нейроспецифичные белки, обнаруженные в сыворотки крови больных и определить их количественные различия не выявляемые другими методами.
- Проводятся исследования функционирования нейрональных протеинкиназ и основных сигнальных систем, участвующих в процессах нейротрансмиссии и нейропластичности с использованием современных методов (генотипирование полиморфизмов, секвенирование, оценка экспрессии генов и кодируемых ими белков).
- Впервые изучается роль абзимов (каталитически активных антител) в патогенезе психических расстройств, оценивается связь изучаемых активностей с особенностями клинического течения, нейровоспалением, цитокиновым профилем и другими показателями иммуного ответа при психических расстройствах.
- Актуальным остается направление изучения оценки уровня и роли окислительного стресса при психической патологии на различных уровнях их проявления (рецепторном, клеточном, системном, организменном). Степень повреждения ГЭБ при психических расстройствах оценивается в комплексе с изучением молекул клеточной адгезии, хемокинов и ростовых факторов с применением машинного обучения.
- Новыми перспективными направлениями лаборатории являются исследование нарушений миелинизации в областях и структурах головного мозга при основных психических расстройствах с применением уникальной методики оценки изменения миелинизации с помощью молекулярной протонной фракции; изучение нейрофизиологических процессов ЭЭГ методами для оценки когнитивного дефицита и анализ ассоциаций выявляемых нейровизуализационных нарушений с периферическими маркерами нейродеструкции.
- Разрабатываются новые подходы к прогнозированию, диагностике и лечению психических расстройств и технологические основы персонализированной терапии посредством идентификации фармакогенетических и молекулярно-биологических механизмов лекарственно-индуцированных побочных эффектов психотропной фармакотерапии (метаболического синдрома, гиперлактинемии и тардивной дискинезии).
- Использование нейрональных клеточных линий и анимальных моделей психических расстройств позволяют проводить экспериментальные работы по изучению новых молекулярных механизмов патогенеза психических расстройств, создание прогностических моделей развития патологии и проводить оценку влияния препаратов в экспериментах на клетках ЦНС непосредственно.
Оборудование, которое применяется в работе
Коллектив обладает современным высокотехнологичным оборудованием, необходимым для выполнения исследований:
системы ПЦР для детекции в режиме реального времени QuantStudio™ 5 Real-Time PCR System (Applied Biosystems, США), Амплификатор DT-prime (ДНК-Технология, Россия); амплификаторы российского и зарубежного производства Termocycler «Bis» М-111 и Veriti 96well Termocycler (ThermoFisher Scientific, США); секвенатор Ion Torrent PGM (ThermoFisher Scientific, США); автоматическая станция выделения нуклеиновых кислот KingFisher Flex (ThermoFisher Scientific, США); спектрофотометр NanoDrop 8000 (Thermo Scientific, США); мультиплексные анализаторы MAGPIX и Luminex 200 (Luminex corp, USA); мультимодальный микропланшетный ридер Varioskan LUX (ThermoFisher Scientific, США); система визуализации гелей и мембран iBright™ FL1500 Imaging System (Thermo Fisher Scientific, США); автоматическая переносная станция для вестерн-блоттинга iBind™ Western Device (Thermo Fisher Scientific, США); спектрофотометр Agilent Cary 60 (Agilent, США); система высокопроизводительного клеточного анализа CellInsight CX7 HCS (Thermo Fisher Scien-tific, США); высокоэффективный жидкостный хроматограф высокого давления LicArt 62 С (LicArt, Россия); жидкостный хроматограф АКТА Pure (GE, США); жидкостный хроматограф JETchrom (JETchrom, Россия); гомогенизатор ультразвуковой Sonicator Q125 (Qsonica, США); автоматические ИФА-анализаторы, спектрофлюориметр; проточный цитофлюориметр.
Образовательная деятельность
На базе лаборатории выполняют курсовые и дипломные работы, бакалаврские, магистерские и кандидатские диссертации студенты и аспиранты Сибирского государственного медицинского университета, Томского НИМЦ и Томского государственного университета.
Научные кадры
Иванова Светлана Александровна - заведущая лабораторией, доктор медицинских наук.
Контакты:
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/ivanova-svetlana-aleksandrovna/
https://www.webofscience.com/wos/author/record/C-5333-2012
https://elibrary.ru/author_profile.asp?id=133158
Краткая информация:
Заместитель директора по научной работе НИИ психического здоровья Томского НИМЦ, заведующая лабораторией молекулярной генетики и биохимии НИИ психического здоровья, профессор кафедры психиатрии, наркологии и психотерапии Сибирского государственного медицинского университета.
С.А. Иванова является автором более 1000 научных трудов, в том числе – более 650 публикаций, индексируемых в базе данных РИНЦ и более 300 публикаций в базах данных Web of Science и Scopus. Является автором и соавтором 25 монографий, 26 методических рекомендаций и пособий для врачей, 45 результатов интеллектуальной деятельности (29 патентов на изобретение РФ и 16 свидетельств на программы и базы данных), 14 новых медицинских технологий. Индекс Хирша РИНЦ равен 35, индекс Хирша в международных базах данных Scopus - 23, Web of Science - 22. Под ее руководством и консультированием защищены 2 докторских и 20 кандидатских диссертаций. Заместитель председателя Ученого совета НИИ психического здоровья Томского НИМЦ, член Ученого совета Томского НИМЦ, член Совета по защитам докторских и кандидатских диссертаций 24.1.215.05 по специальности 3.1.17 – «Психиатрия и наркология» (биологические науки, медицинские науки) при НИИ психического здоровья Томского НИМЦ; член Диссертационного совета 24.1.215.03 по специальности 1.5.7. Генетика (биологические науки, медицинские науки) при НИИ медицинской генетике Томского НИМЦ; заместитель главного редактора журнала «Сибирский вестник психиатрии и наркологии» (Томск), член комитета биологической психиатрии редакционной коллегии ежемесячного научно-практического журнала «Психическое здоровье» (Москва); Председатель секции молекулярной психиатрии Российского общества психиатров (РОП) эксперт Российского научного фонда и РАН.
Федоренко Ольга Юрьевна - ведущий научный сотрудник, доктор медицинскихй наук.
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.+7(3822)723829
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/fedorenko-olga-yurevna/
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
+7(3822)723829
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/smirnova-lyudmila-pavlovna/?sphrase_id=420624
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
+7(3822)723832
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/boyko-anastasiya-sergeevna/
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/levchuk-lyudmila-aleksandrovna/
Левчук Л.А. в 2005 году успешно закончила магистратуру Томского государственного университета (кафедра цитологии и генетики). В 2008 году защитила кандидатскую диссертацию по специальностям «Физиология» и «Патологическая физиология». Является соавтором более 160 научных публикаций в отечественной и зарубежной печати (Индекс Хирша в РИНЦ – 17; Web of Science/Scopus – 5), в том числе 4 монографий, 11 методических рекомендаций и пособий для врачей, 9 патентов на изобретение РФ и 2 свидетельств на базы данных, 3 новых медицинских технологий. С 2006 по 2024 гг. принимала участие в 23 грантах и контрактах, в 3 из них выступала в качестве руководителя.
Левчук Л.А. на протяжении последних лет активно проводит исследования по поиску биомаркеров психических и аддиктивных расстройств и нейродегенеративных заболеваний. Научные работы Левчук Л.А. неоднократно входили в число победителей Всероссийских и международных конкурсов ученых и специалистов. Лауреат конкурса Томской области в сфере образования, науки, здравоохранения и культуры за высокие достижения в сфере образования и науки (2010, 2016, 2023 гг.). Награждена почетным знаком «Будущее Томской области» (2018 г.).
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/vyalova-natalya-mikhaylovna/
В 2005 году с отличием закончила магистратуру Томского государственного университета (кафедра цитологии и генетики). В 2007 году защитила диссертацию на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности «физиология». С 2008 года продолжает работу в институте психического здоровья в должности старшего научного сотрудника. В область научных интересов Н.М. Вяловой входит исследование полиморфизма генов внутриклеточных киназных сигнальных путей, нейротрофических факторов, нейромедиаторной системы при аффективных расстройствах настроения.
Н.М. Вялова является соавтором более 150 научных трудов, в том числе – 96 публикаций, индексируемых в базах данных РИНЦ, Web of Science и Scopus, 3 монографий, 6 методических рекомендаций и пособий для врачей, 6 патентов на изобретение РФ, 3 новых медицинских технологий. Научные достижения Н.М. Вяловой отмечены наградами различного уровня. Является победителем конкурса 2015-2017 гг на получение стипендии Президента РФ молодым ученым и аспирантам. Н.М. Вялова участвовала в выполнении 19 грантов ведущих Российских научных фондов.
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/epimakhova-elena-viktorovna/
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/poltavskaya-evgeniya-grigorevna/
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/mednova-irina-andreevna/
Меднова Ирина Андреевна, 1992 г.р., в 2016 году с отличием окончила медико-биологический факультет Сибирского государственного медицинского университета по специальности «медицинская биохимия». В 2017 году окончила интернатуру по специальности «Клиническая лабораторная диагностика». диагностика». С 2015 г. работает в лаборатории молекулярной генетики и биохимии НИИ психического здоровья. В 2020 году успешно защитила кандидатскую диссертацию на тему «Клинико-биохимические и метаболомные особенности больных параноидной шизофренией с сопутствующим метаболическим синдромом» по специальностям «Психиатрия» и «Патологическая физиология».
Является автором более 100 публикаций; принимала участие в реализации 6 грантов Российского научного фонда (1 - руководитель, 5 – исполнитель). Лауреат стипендии Президента РФ для молодых ученых и аспирантов, осуществляющих перспективные научные исследования и разработки по приоритетным направлениям модернизации российской экономики (2021-2023 гг). Лауреат премии администрации Томской области в сфере образования, науки, здравоохранения и культуры для молодых научных и научно-педагогических работников, специалистов, докторантов и аспирантов (2022). Лауреат премии Законодательной Думы Томской области для молодых ученых и молодых дарований (2022). За успехи в работе награждена Благодарственным письмом НИИ психического здоровья ТНИМЦ СО РАН (2017, 2020), почетным знаком “Будущее Томской области” (2023)Благодарственным письмом Администрации Томской области (2024).
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
+7 (3822) 72-38-29
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/dmitrieva-elena-mikhaylovna/
Михалицкая Е.В., 1991 г.р., прошла обучение в Сибирском государственном медицинском университете (СибГМУ), по специальности «Врач биохимик» в 2015 году. В 2022 году окончила очную аспирантуру НИИ психического здоровья Томского НИМЦ и в результате получила ученую степень кандидата медицинских наук по специальности «Психиатрия».
Работает в коллективе НИИ психического здоровья с 2014 года, а с 2022 года занимает должность научного сотрудника отделения аффективных состояний.
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/paderina-osmanova-diana-zakirovna/
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/pozhidaev-ivan-vyacheslavovich/?sphrase_id=420528
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/nii-psikhicheskogo-zdorovya/galkin-stanislav-alekseevich
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
+7(3822)723829
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
89618881944
Сотрудничество: наиболее активно международное сотрудничество с 2005 по 2022 год осуществлялось с Гронингенским университетом (Нидерланды) в области исследования шизофрении и депрессии. С 2015 года коллектив лаборатории сотрудничает с Bio-Molecular Imaging Center, департаменом по радиологии Университета Вашингтона (Сиэтл, США) в области изучения изменений миелинизации головного мозга при психических расстройствах. Из других ведущих европейских университетов сотрудничество осуществлялось с Тюбингенским университетом (Германия) и Наймегенским университетом (Нидерланды).
С российскими организациями коллаборация осуществляется с СибГМУ, ТГУ, НИИ нейронаук и фундаментальной медицины (Новосибирск), ИХБФМ (Новосибирск), ИБМХ (Москва), НЦПЗ (Москва), НИИ НИЦЭМ им. Н. Ф. Гамалеи (Москва), Сколковским институтом науки и технологий и другими научно-исследовательскими центрами и институтами.
С 2014 года на базе лаборатории выполнялись более 35 грантов и контрактов различных фондов и организаций; за последние десять лет опубликовано 12 монографий, 24 РИД (патенты и свидетельства на регистрацию баз данных и программ ЭВМ), 10 пособий для врачей и методических рекомендаций, 15 новых медицинских технологий; более 60 полнотекстовых статей в высокорейтинговых журналах Q1-Q2.
Гранты (выборочно)
1. РНФ № 14-35-00023 «Лаборатория фармакогенетических исследований персонализированной терапии психических и нейродегенеративных расстройств», 2014-2016;
2. Грант Президента Российской Федерации МК-3854.2014.7 «Нейрогуморальные системы в патогенезе депрессивных и аффективных расстройств: поиск биомаркеров и разработка новых подходов к диагностике, прогнозированию и фармакотерапии» (2014-2015 гг.)
3. РНФ № 14-15-00480 «Поиск ключевых биомаркеров патогенеза социально значимых эндогенных психических расстройств», 2014-2016;
4. РНФ № 18-15-00011 «Шизофрения, сочетанная с метаболическим синдромом: клинико-конституциональные факторы и молекулярные маркеры», 2018-2020;
5. РНФ № 18-15-00053 «Поиск периферических маркёров ассоциированных с нарушением миелинизации головного мозга и патогенезом заболевания при шизофрении», 2018-2020 гг., продлен на 2021-2022 гг.
6. РНФ № 19-15-00023 «Клинические особенности и поиск потенциальных биомаркеров коморбидности алкоголизма и аффективных расстройств», 2019-2021,
7. Грант РНФ 19-75-10012 «Новые подходы к фармакогенетике метаболического синдрома при шизофрении», 2019–2022 гг.
8. Грант РНФ№ 21-75-00071 «Протеолитическая активность каталитических антител при основных эндогенных психических расстройствах: перспективы в дифференциальной диагностике и оценке прогноза течения шизофрении и биполярного аффективного расстройства», 2021-2023 гг.
9. Грант РНФ №21-15-00212 «Роль метилирования ДНК и полиморфизма генов глутаматергической системы в клинике, когнитивном дефиците и терапии шизофрении», 2021-2023,
10. РНФ № 22-15-00084 «Униполярная и биполярная депрессия: трансдиагностичность или специфичность потенциальных клинических, нейрофизиологических, молекулярно-биологических и метаболомных маркеров?», 2022-2024,
11. Грант РНФ № 22-75-00023 «Нейрокогнитивные корреляты системы вознаграждения мозга в структуре когнитивного профиля при алкоголизме», 2022-2024 гг.
12. РНФ № 22-25-00633 «Ростовые факторы и хемокины при шизофрении: новые подходы к анализу данных», 2022-2023;
13. РНФ №23-75-00023 «Поиск новых молекулярных механизмов аффективных расстройств с целью разработки методов диагностики и прогноза с использованием протеомных подходов и нейровизуализации», 2023-2026
14. РФФИ № 14-04-01157-а «Поиск биомаркеров депрессивных и аффективных расстройств», 2014-2016;
15. РФФИ № 14-04-31876 «Эксайтотоксичность и деструктивные процессы в патогенезе лекарственно-индуцированных двигательных расстройств у больных шизофренией» (2014-2015 гг.)
16. РФФИ № 14-04-31925 мол_а «Роль нарушения нейропластичности в патогенезе аффективных расстройств» (2014-2015 гг.)
17. РФФИ № 17-29-02205 офи_м «Разработка молекулярно-генетической панели депрессивных расстройств на основе полиморфизмов генов нейрональных киназ, нейротрофических белков и генов серотонинергической системы», 2017-2020;
18. РФФИ № 17-29-06035 офи_м «Новые подходы к фармакогенетике антипсихотик-индуцированной гиперпролактинемии у больных шизофренией», 2017-2020;
19. РФФИ № 19-315-90032 «Регуляторные киназы и мозговой нейротрофический фактор при алкогольной зависимости и депрессивных расстройствах», 2019-2021
20. ФЦП 14.601.21.0015 «Разработка методических подходов к разработке прогноза реализации приоритета «Переход к персонализированной медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных)» в рамках темы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса на 2014-2020 годы», 2017-2018 гг.